Klimatyzacja samochodowa, jak każdy inny układ w samochodzie wymaga regularnego serwisowania. Wymiana zużytych i uszkodzonych elementów zapewnia wydajne działanie systemu chłodzenia powietrza. Część prac można wykonać samodzielnie, jednak w przypadku większych usterek niezbędna będzie pomoc serwisu.
Do czynności, które nie wymagają specjalistycznej wiedzy i umiejętności, należy z pewnością odgrzybianie klimatyzacji. Do tego celu potrzebny będzie jednak ozonator, który pomoże zdezynfekować instalację i usunąć z niej drobnoustroje chorobotwórcze. Przed rozpoczęciem ozonowania należy zamknąć okna i drzwi, ustawić w samochodzie obieg wewnętrzny i na kilkanaście minut włączyć niewielki nadmuch. Osoby, które nie dysponują ozonatorem, mogą w dobrych sklepach motoryzacyjnych kupić specjalistyczne preparaty do odgrzybiania.
Jeżeli układ działa nieprawidłowo, lepiej nie naprawiać go na własną rękę. Przed rozpoczęciem prac naprawczych należy znaleźć źródło problemu, a do tego potrzebny jest specjalistyczny sprzęt, dzięki któremu mechanik może postawić prawidłową diagnozę. Zdaniem fachowców każdy problem z klimatyzacją można rozwiązać i nie wszystkie naprawy muszą być kosztowne. Zdarza się jednak, że mechanik zaleca wymianę całej sprężarki, a po wykonaniu szczegółowej diagnostyki okazuje się, że uszkodzeniu uległo jedynie sprzęgło kompresora klimatyzacji. Za nieprawidłową pracę układu odpowiedzialne mogą być także zawory i czujniki, zanieczyszczenia wewnątrz układu, czy też uszkodzone przewody. Usunięcie tych usterek samodzielnie jest niemożliwe.